Возможные аппаратные причины сбоев:
1. Плохое охлаждение (перегрев) процессора, северного моста, жесткого диска и видеокарты, особенно у ноутбуков.
2. Сбои по питанию при пиковых нагрузках - проверьте соответствие мощности блока питания потребляемой мощности оборудования (особенно после его апгрейда), надёжность контактов в разъёмах питания и отсутствие вздувшихся конденсаторов. У ноутбуков - состояние аккумулятора, блок питания и контакты его разъёмов.
Для мониторинга температуры и питающих напряжений можно использовать SpeedFan.
3. Нехватка или сбои памяти - проверьте память на ошибки и настройки файла подкачки.
Для проверки памяти, при загрузке с CD, нажмите "M" - Windows Memory Diagnostic
4. Сбои файловой системы - проверьте диски на ошибки логические и физические (битые кластеры).
Для проверки дисков можно использовать программы из Hiren's BootCD - при загрузке с CD, нажмите "H".
Для проверки из-под Windows рекомендую - Portable Norton Disk Doctor 2007 Rus и Victoria для Windows. 
Программы для тестирования железа.
Скрытие бэд-блоков на хардах 1-я часть.
Скрытие бэд-блоков на хардах 2-я часть.
Документация к программе Victoria
